En un futuro muy lejano, los humanos ya no habitan la Tierra. Se desconoce la causa de su desaparición (o quizás su destrucción), pero su ausencia dejó un vacío disponible para que otra especie inteligente lo ocupara. Durante el transcurso de incontables generaciones, la especie de las humildes abejas evolucionó hasta llenar ese vacío. Crecieron en tamaño e inteligencia, y se convirtieron en una sociedad sumamente avanzada. Se hicieron llamar melíferas.

Las melíferas han realizado importantes avances tecnológicos y adaptaciones de tecnología de los vestigios humanos, hasta llegar a los viajes espaciales, pero la especie aún no ha conseguido escapar por completo de su propia historia evolutiva. Aunque la sociedad melífera ha sobrepasado la corta esperanza de vida de sus predecesoras, esta longevidad está unida al coste de una prolongada hibernación. Cada año, los miembros de la especie se mantienen activos durante unos pocos meses (fase de trabajo) antes de hibernar durante el resto del año (fase de hibernación).

En "Apiario", cada jugador controla una facción que empezará la partida con escasos suministros: una colmena, unos cuantos recursos y algunas abejas obreras. Te aguarda un desafío de colocación de obreras y la construcción de tu colmena: explora planetas, reúne recursos, desarrolla tecnología y crea grabados para mostrar la fortaleza de tu facción (representada por puntos de victoria) durante la fase de trabajo de un año. No obstante, la fase de hibernación se acerca y tus obreras sólo podrán realizar unas pocas acciones antes de tener que hibernar. ¿Podrás prosperar o solo sobrevivir?